綿陽市及安州區(qū)原定于2018年底前全部消化歷史堆存的磷石膏，實際消減不到20%，目前仍堆存約210萬噸。堆場“三防”措施不到位，滲濾液和沖洗廢水未經處理直排。安州區(qū)天明磷化工、啟明星磷化工等黃磷企業(yè)長期違法生產，污染十分嚴重。綿竹市磷石膏“產用平衡”整改任務未按期完成，新市工業(yè)園區(qū)內龍蟒磷化工、三佳飼料等企業(yè)違規(guī)處理生產廢水，偷排磷石膏滲濾液，磷石膏堆場周邊地下水總磷濃度最高超過地表水Ⅲ類標準569倍。

一些地方和部門在整改過程中打折扣、搞變通，降低整改要求。攀枝花市擅自取消整改方案明確的工作任務，對運行不正常的污水處理廠整改缺乏階段性目標，同時未按要求對全市污水處理設施建設明確具體時限，甚至還擅自放寬攀鋼集團所屬礦業(yè)有限公司石灰石礦在自然保護區(qū)違法生產活動的整改時限，導致生態(tài)破壞嚴重。

一些地方對群眾環(huán)境舉報重視不夠，上面不督促，下面辦理不認真、不徹底。群眾反映的西昌市馬道大山坡廢舊回收市場違規(guī)回收廢舊電池、電瓶問題，西昌市在未落實整改要求情況下，即于2017年11月向涼山州政府上報整改完成，涼山州未經核實即于當日向省政府上報整改完成。自貢市沿灘區(qū)九洪鄉(xiāng)蓮花垃圾處理廠嚴重環(huán)境污染問題，自貢市于2018年8月上報整改完成，但此次督察發(fā)現，該處理廠仍積存約4.5萬立方米垃圾滲濾液，且部分滲濾液違規(guī)處置，導致周邊地下水和沱江受到污染。